בשעה 21:10 הגיע רכב ממ.פ שוועפט לכיוון המחסום בכניסה למקום, ממנו הגיח מחבל חמוש שהסתער וביצע ירי לעבר כוחות הביטחון שפעלו במעבר. מיד לאחר הפיגוע המחבל נמלט מהמקום רגלית לכיוון מ.פ שוועפאט והרכב המשיך בנסיעה לכיוון ההפוך. לוחמי מג״ב שהיו במעבר השיבו לעבר המחבל בירי.
כתוצאה מפיגוע הירי במחסום נפגעה אשה באורח אנוש. מאבטח אזרחי שפעל במעבר נפצע באורח קשה ופונה לבית החולים לקבלת טיפול רפואי. בנוסף נפצעו שני לוחמי מג״ב נפצעו באורח קל מרסיסים ופונו לקבלת טיפול רפואי בבית החולים.
לאחר הפיגוע הוזעקו כוחות משטרה ומג״ב למקום בפיקוד מפקד מחוז ירושלים והתחילו בסריקות ופעולות נוספות בזירה ובאזור. בהמשך הגיעו לזירה השר לבט״פ עמר בר לב ומפכ״ל המשטרה רנ"צ קובי שבתאי וקיימו הערכת מצב יחד עם ממ״ז ירושלים, מפקד מג״ב, מפקדים וכוחות הביטחון.

השר בר-לב אמר: "זהו ערב קשה. משטרת ישראל וכוחות הביטחון מנהלים כעת מצוד אחר המחבל, והם יניחו עליו את היד, חי אות מת".
בשעות האחרונות פועלים כוחות משטרת ישראל ומשמר הגבול יחד עם שב״כ וכוחות צה״ל למצוד וסריקות אחר המחבל ומעורבים נוספים בפיגוע הירי.
בפעילות שנמשכת גם בשעות אלו, נעצר הערב חשוד אחד בחשד למעורבות בפיגוע.
בשעה זו כוחות גדולים של משטרת מחוז ירושלים ומג״ב עוטף ירושלים, בשילוב יחידות משטרתיות מיוחדת ומסוק המערך האווירי של משטרת ישראל, שב״כ וכוחות צה״ל ממשיכים לפעול באזור במצוד אחר המחבל ומעורבים נוספים תוך ביצוע מגוון רחב של פעולות ופעילות ללכידתם.
אל חדר הטראומה בהדסה הר הצופים פונו אתמול (מוצאי שבת) שני פצועים מפיגוע הירי באזור שועפאט. בחור בן 30 במצב קשה עם פגיעת ירי בראש, הוא הועבר לבית החולים הדסה עין כרם לניתוח נוירוכירורגי. חיילת בת 19 במצב אנוש אשר לצערנו, לאחר מאמצי החייאה נאלצו הצוותים לקבוע את מותה. מבית חולים הדסה נמסר "הבחור בן ה-30 אשר נפצע אתמול באורח קשה באירוע הירי באזור שועפאט, עבר במהלך הלילה ניתוח על ידי צוות נוירוכירורגי בהדסה עין כרם.
הבוקר מאושפז ביחידה לטיפול נמרץ נוירוכירורגי כשהוא מורדם ומונשם. מצבו מוסיף להיות קשה."

הנשיא יצחק הרצוג, התייחס הפוקר לפיגוע "שולח תנחומים למשפחתה האבלה של לוחמת צה״ל, סמל נועה לזר ז״ל ששמחת החג הפכה עבורם לאבל נורא ומתפלל להחלמת הפצוע מפיגוע הירי בירושלים. אף מחבל נתעב לא ישבור את רוחנו. נילחם בטרור ונמשיך לבנות את חיינו ולשמור על שגרת החגים. סומכים על צה״ל ועל כוחות הבטחון".